En 1153, à la demande du seigneur de Fresnes, l'église Saint-Eloi est érigée, à mi-chemin entre la seigneurie de Fresnes, Tourvoie et Berny, en bas des terres labourables. On estime qu'en 1458, d'après les sources écrites, Fresnes ne comptait qu'une soixantaine d'habitants. Les seigneuries, propriétés et château passent peu à peu dans les mains des abbés de de Saint-Germain-des-Prés avant d'être confisqués lors de la Révolution française. A cette époque, les habitants forment une communauté villageoise d'environ 260 âmes et exploitent des terres labourables, bois, vignes, prés et prairies d'une superficie égale à celle de la commune d'aujourd'hui, environ 358 hectares. Les transformations post-révolutionnaires rattachent Fresnes au département de
Paris, district de Bourg- l'Egalité (Bourg-la-Reine), canton de Choisy-le-Roi. Les années qui suivent n'apportent que peu de changements : les activités demeurent agricoles, l'artisanat (fabrique de tuiles, briqueteries) et les carrières constituent les seules activités non agricoles.