De mémoire, je cite plusieurs raisons :

-De nombreux déluges ont eu lieu sur toute la surface de la Terre. C’est d’ailleurs pour cela que de nombreuses civilisations à travers le monde racontent des histoires dessus ! Bref, durant ces déluges, de nombreuses espèces aquatiques ont transité dans des lieux éloignés de leurs écosystèmes habituels et s’y sont habitués. Je me rappelle plus le nom de ce savant français disqualifié par ces pairs au 19eme siècle pour avoir trouvé une espèce de coquillage sur les flancs de l’Himalaya : on l’a accusé de tricherie, de mensonge alors qu’un siècle pour tard, on s’est aperçu de la finesse de son observation : même l’himalaya a été recouverte par les eaux!

-Le Sahara n’a pas toujours été un désert. On a même des preuves qu’elle a été occupée par une forêt luxuriante dans les temps préhistorique. Donc il y’avait des fleuves se déversent dans les mers. Du coup, il se peut que ces lacs et ses habitants soient les vestiges de ces temps luxuriants !

Comme l'a justement dit Carter le Sahara n'a pas toujours été comme on le connais aujourd'hui. On n'a pas apporté des petits poissons dans un bocal pour qu'ils peuplent les points d'eau du désert.
Ces poissons sont le résultat d'une évolution qui a suivit celle du désert depuis le temps où les poissons pouvaient encore arriver jusque là.

Bonjour,
C'est très, très, très......, très vieux.
La mer occupait cette zone de -400 millions d'années à 60 millions d'années (environ, on est pas à deux ans près).
Vers -250/-200 millions d'années, période humide, végétation tropicale luxuriante.
Vers -60 millions d'années, la mer s'est retirée, déposant des sédiments.
Puis activité volcanique, et alternances de périodes sèches et humides façonnent et modifient le paysage, qui, jusqu'en -8000 ans comporte encore de nombreux fleuves et lacs (des peintures rupestres en attestent).
Depuis -4000 ans, le désert s'étend, de plus en plus, et encore actuellement.

Les lacs et fleuves restant ne sont que les vestiges du passé.
Curiosité: l'Okavango coule.....puis disparaît dans les sables et n'atteint jamais la mer