Ce protocole de communication est utilisé sur un réseau dans le cadre d'une relation "Client/Serveur". Il faut utiliser un logiciel spécifique pour installer et configurer le réseau, le ou les serveurs et le ou les clients. La sécurisation d'un réseau utilisant internet n'est pas à la portée du premier venu.
Je te suggère plutôt de fractionner tes fichiers trop gros pour être acceptés par ton FAI, de les comprimer avec un logiciel ad'hoc (Winzip par exemple si on est sous Windows - les utlisateurs de Linux ont l'avantage d'avoir un outil de compression/décompression intégré).
Regarde ici (entr'autres:
http://sebsauvage.net/logiciels/splitfile.html
http://www.01net.com/telecharger/windows/Utilitaire/compression_et_decompression/
"Le File Transfer Protocol (protocole de transfert de fichiers), ou FTP, est un protocole de communication destiné à l'échange informatique de fichiers sur un réseau TCP/IP. Il permet, depuis un ordinateur, de copier des fichiers vers un autre ordinateur du réseau, d'administrer un site web, ou encore de supprimer ou de modifier des fichiers sur cet ordinateur."
http://fr.wikipedia.org/wiki/File_Transfer_Protocol
Il faut un logiciel spécifique pour pouvoir l'utiliser.
"La suite des protocoles Internet est l'ensemble des protocoles qui constituent la pile de protocoles utilisée par Internet.
Elle est souvent appelée TCP/IP, d'après le nom de deux de ses protocoles : TCP (Transmission Control Protocol) et IP (Internet Protocol), qui ont été les premiers à être définis."
http://fr.wikipedia.org/wiki/TCP/IP
Un tutoriel d'introduction à TCP/IP simple mais bien fait:
http://sebsauvage.net/comprendre/tcpip/index.html