Ayant le ballon dans la peau, il a passé la plus grande partie de son enfance sur un terrain de foot avant de rejoindre le centre de préformation de Ploufragan. Il a intégré ensuite le centre de formation du Stade rennais à l'âge de 15 ans. En 2003, le joueur a franchi un grand pas dans sa carrière en remportant la Coupe de Gambardella tout en atteignant la finale du Championnat d'Europe des moins de 17 ans avec l'équipe nationale. Convoité par plusieurs grands clubs européens, il a préféré rester en Bretagne pour parfaire son apprentissage sous la direction de son père Christian. En effet, il signe son tout premier contrat professionnel à
Rennes avant de faire sa première apparition en Ligue 1 en février 2004 lors du match face à
Auxerre. Le Breton continua ensuite sa progression la saison 2005 en participant à l'aventure qui a mené l'équipe rennaise à la quatrième place du championnat national. Toutefois, c'est durant la saison 2005 - 2006 que Yoann s'est révélé aux yeux du monde aux côtés de grands joueurs comme Petr Cech, Kim Kallström et le
Suisse Alexander Frei.