Xavi ne pourra cependant partager aucune autre évolution de l'équipe puisqu'il sera aussitôt affecté. Ainsi, au sein du Barça B, il ne pourra réaliser que la saison 1997-1998 avec 61 matchs disputés et 2 buts signés. Ensuite, à partir de 1998, il adhère à l'équipe première du club, engageant ainsi un pas de plus dans le monde professionnel. Il réalise des débuts fulgurants en participant d'emblée à la Supercoupe d'Espagne 1998 où l'équipe catalane fait face au RCD
Majorque. Il se fera dès lors remarquer puisqu'il réussira à inscrire un but lors de cette rencontre. Cela lui vaudra le respect de ses coéquipiers ainsi que de l'entraîneur d'antan, Louis Van Gaal. Ainsi, l'Espagnol verra ses apparitions sur le terrain se multiplier. Il aura alors l'occasion d'apporter une contribution très positive au sein de l'équipe, notamment lorsque l'arsenal se voit attribuer le titre de Champion d'Espagne en 1999. Cet exploit sera renouvelé trois fois, c'est-à-dire en 2005, en 2006 et en 2009. Avant d'en arriver à ce point cependant, le joueur catalan aura droit à une autre tournure pendant la saison 1999-2000. Son coéquipier d'antan, Josep Guardiola, doit se retirer du terrain à cause d'une certaine blessure.