En effet, sa protégée, Laure Manaudou le quitte pour un autre entraîneur, Luca Marin son petit ami, et s'envole pour l'
Italie. Au mois d'août de la même année, il est mêlé à une enquête judiciaire suite à une plainte déposée par le Cercle des nageurs de Melun Val de Seine, concernant des irrégularités financières, pendant la présidence de son père. Depuis, il se remet du départ de Laure et continue d'entraîner ses nageurs. En 2009, sa carrière d'entraîneur prend une toute autre tournure quand il affirme que son club, Canet-en-Roussillon, ne l'aurait pas payé depuis plusieurs mois. Suite à ces allégations, il est victime d'une mise à pied, et sera ensuite renvoyé pour faute grave le 09 février 2009. Si Pierre Rollin, président du Club, affirme que depuis longtemps Lucas n'a pas respecté les budgets du club et va plus loin en le qualifiant de personne ingérable et même sulfureuse. Arlette Franco, député et maire
UMP de Canet-en-Roussillon, et ses nageurs, Xavier Leprêtre, Camélia Potec et Magalie Rouesseau le soutiennent. Depuis, il n'a plus de club et révèle même aux journalistes qu'il ne regrette rien, en ajoutant « Je sais en tout cas qu'on me doit encore certaines choses ».