Vingt ans plus tard, ce sont près de 300 millions de bouteilles qui sont vendus en Amérique. En 1990, Gustave Leven quitte la présidence du Groupe et deux ans plus tard,
Nestlé prend le contrôle de Perrier devenant le leader mondial de l'eau embouteillée avec près de 73 marques comme Vittel, Valvert, Contrex ou Nestlé Aquarel. Les années 2000, sont marquées par l'innovation. Le « Perrier Classique » est disponible dans les formats en verre en 75 cl, 33 cl et 20 cl ; on le trouve également en boîte, 25 cl ou en 33 cl, et dans les formats en plastique, en 1 litre et 50 cl. En 2003, Perrier lance « Eau de Perrier », une eau pétillante subtilement aromatisée et sans sucres. « Eau de Perrier » est disponible en trois parfums :
citron, citron-vert et pamplemousse rose et dans trois formats : 75 cl, 33 cl et 20 cl. Elle est proposée dans les restaurants, afin de faciliter la digestion. La dernière innovation de la marque, date de 2007. Le « Perrier fluo » se positionne désormais à côté des sodas avec quatre parfums : saveur agrumes citron, saveur orange
litchi, saveur citron vert kiwi et saveur cerise
gingembre.