Le jeune Maurice milite à la Ligue d'action universitaire républicaine et socialiste aux côtés de Pierre Mendès-France. A 21 ans, il entre dans l'administration publique au Ministère de l'air. En 1935, il est nommé rédacteur au Ministère de l'intérieur. Au début de la
seconde guerre mondiale, il rejoint le gouvernement de Pétain. Sous le
régime de Vichy, il est nommé secrétaire général de la préfecture de la Gironde, à
Bordeaux, en zone occupée. De 1942 à 1944, il dirige le Service des questions juives. Il recense les juifs de la région bordelaise et organise leur arrestation et leur déportation vers le camp de Drancy. Près de deux mille juifs sont ainsi remis aux autorités allemandes et déportés vers des camps de concentration. Après la guerre, Maurice Papon n'est pas inquiété et s'est même vu confirmé dans ses fonctions par le
Général de Gaulle. Il réintègre le Ministère de l'intérieur et poursuit alors une carrière de haut fonctionnaire : préfet de
Corse, puis préfet de Constantine en
Algérie. Il est fait chevalier de la Légion d'honneur en 1948, puis officier de la Légion d'honneur en 1956. En 1958, Maurice Papon est nommé préfet de police de Paris.