En 2005, elle réintègre France Télévision : depuis le 26 septembre 2005, elle présente avec brio « Soir 3 », le journal de la nuit de
France 3. Toutefois, Marie Drucker annonce le 13 décembre 2006 qu'elle y renonce durant la campagne pour l'élection présidentielle française, c'est-à-dire du 23 février au 7 mai 2007, après que le journal France Soir, relayé par d'autres médias, ait dévoilé sa relation avec François Baroin, alors ministre de l'Outre-Mer du gouvernement
Villepin, actuellement député UMP et considéré comme le fils spirituel de l'ancien Président
Jacques Chirac. Cette décision, appréciée par France Télévision, mettra fin à toute polémique. Le 16 décembre 2006, Marie Drucker a reçu des mains de
Patrick Poivre d'Arvor, à
Courchevel, en Savoie, le Trophée des Femmes en Or 2007 dans la catégorie communication, qui récompense des femmes incarnant des valeurs essentielles dans la société (arts, sciences, mode, etc.). C'est à cette occasion qu'elle affirme son sacerdoce : « la seule chose importante est de transmettre une information la plus exigeante et rigoureuse, travail collectif d'une grande rédaction de service public ».