Des fusions eurent lieu à partir de 1995, d'abord avec la deuxième compagnie aérienne chilienne, Ladeco, puis avec Fast Air. En 2004, LAN Chile avait quatre filiales : LAN Peru, LAN Ecuador, LAN Dominicana et LAN Express. Ce sera la naissance officielle de la nouvelle marque LAN Airlines. Une autre filiale fut ouverte en 2005 : LAN Argentina, cette dernière compagnie effectuant des vols nationaux et internationaux à partir de
Buenos Aires. LAN Airlines est désormais la seconde compagnie aérienne argentine derrière Aerolineas Argentinas. LAN Airlines est aujourd'hui une grande société de holding regroupant de nombreuses compagnies : LAN Argentina, LAN cargo, LAN Chile, LAN Courier, LAN Ecuador (
Equateur), LAN Express, LAN Peru et enfin ABSA, compagnie brésilienne de fret. C'est à ce titre la plus importante structure commune d'Amérique latine. Sa base se situe à l'aéroport international Arturo Merino Benitez à Santiago et le groupe LAN Airlines, réseau Latino-Américain, fait désormais partie de l'alliance one world.