Le juge Burgaud avait alors été soupçonné d'avoir instruit à charge ce dossier alors qu'un juge d'instruction, selon l'article 81 alinéa 1 du code de la procédure pénale, doit instruire à charge et à décharge. Cette polémique a remis au goût du jour l'idée soutenue par certaines personnes qui voudraient que l'on supprime la fonction de juge d'instruction. Mais qu'est-ce qu'un juge d'instruction au juste ? Dans le système judiciaire français, le poste de juge d'instruction est dévolu à un
magistrat qui mène des enquêtes judiciaires. Il faut savoir que le juge d'instruction ne peut décider seul d'ouvrir une enquête : il est en effet désigné par un procureur qui représente le gouvernement. Il peut également être saisi par une personne qui a été victime et qui se constitue partie civile. Pour mener à bien sa mission, le juge d'instruction dispose de pouvoirs judiciaires. En effet, il lui est possible de lancer des enquêtes via des officiers de police judiciaire à qui il a délivré des commissions rogatoires. L'étendue des pouvoirs du juge d'instruction est telle que d'aucuns demandent une réforme du statut de cette fonction.