Elle étudiera cette matière à l'Université. Mais une fois son diplôme en poche, Jennifer ne poursuivra pas dans le monde des molécules. Comme beaucoup d'acteurs et d'actrices, en fin d'études supérieures, Jennifer Garner se tourne vers sa vraie passion : le théâtre. S'émancipant de
New York, Jennifer tout en suivant des cours et cherchant des rôles interessants, travaille en tant qu'hôtesse dans un restaurant de la ville. En 1998, elle démenage à
Los Angeles espérant avoir de nouvelles et meilleures opportunités. Et Jennifer Garner aura eu raison d'y croire. En effet, J.J.Abrams, un réalisateur de séries TV en vogue la repère et lui propose un rôle dans la série « Felicity ». La série permet à Jennifer Garner sous les traits de Sarah de faire ses preuves à l'écran et également de rencontrer son futur mari Scott Foley. A l'arrêt de « Felicity », Jennifer Garner n'a pas à chercher longtemps un nouveau rôle. J.J.Abrams lui offre cette fois-ci le rôle titre de sa nouvelle série tv «
Alias ». Révélation mondiale de la série et de l'actrice dans la peau de l'agent Sydney Bristow.