Dans ce but, il étudie les matières fondamentales à l'époque pour devenir médecin : le grec, le latin, la
philosophie et l'histoire naturelle. Il se joindra, en outre, à son père pour exercer à ses côtés et apprendre davantage la profession. En 1783, il épouse une dénommée Mary Dale avec laquelle il aura six enfants. Un an plus tard, il est diplômé de
chirurgie. James Parkinson est cependant bien plus intéressé par la condition humaine en détresse et préférera s'occuper des pauvres de la paroisse. Il mettra également à profit ses compétences au sein de l'infirmerie d'une usine et sera, de plus, responsable d'un asile « d'aliénés » (le terme était courant à l'époque) afin de rendre la dignité des malades. La folie, en effet, était très mal comprise et James Parkinson fit en sorte que les patients soient soignés avec considération. Très pris par le travail, James Parkinson s'adonne en outre énormément à l'écriture et publiera de nombreux ouvrages médicaux dont un par exemple sur la
goutte, ou encore sur l'appendicite. Parallèlement, James Parkinson se voue à d'autres activités telles que la géologie et la paléontologie.