L'année suivante, Isabelle Huppert apparaît aux côtés de
Christopher Walken dans le film américain « La porte du Paradis ». L'actrice s'offre des rôles dans des films tels que « Coup de torchon », « La Truite », « Coup de foudre », ou encore « Passion » avec Michel Piccoli et Hanna Schygulla. Elle joue ensuite aux côtés de
Coluche dans « La Femme de mon pote ». Après une longue série de films, Isabelle Huppert interprète le rôle phare d'Emma Bovary dans le film « Madame Bovary » de Claude Chabrol en1991. S'ensuivent des apparitions dans des films tels que « La Cérémonie », « Les affinités électives », « Rien ne va plus », « L'Ecole de la chair » ou encore « La vie moderne ». En 2001, Isabelle Huppert offre une excellente prestation dans le rôle d'Erika Kohut pour le film « La Pianiste » de Michael Haneke. Elle jouera aux côtés de Benoît Magimel et
Annie Girardot. Elle brille également dans la comédie policière « Huit Femmes » de François Ozon. On la retrouve aux côtés d'une pléiade d'actrices de talent que sont
Catherine Deneuve, Fanny Ardant, Emmanuelle Béart, Ludivine Sagnier, Firmine Richard et Danielle Darrieux.