En 2006, les sonorités musicales de son troisième album sont orientées vers le monde des plantes; noms de fleurs, plantes grimpantes, flottantes, sauvages ou apprivoisées. L'album Végétal, mené avec brio par la chanson Fleur de Saison, confirme alors à Emilie Simon son statut d'auteur, compositeur et interprète française avec une victoire de la musique en 2007 cette fois-ci dans la catégorie Album de musiques électroniques groove dance. Accompagnée de son ami et musicien Cyril Brissot (lui aussi issu de l'IRCAM), la participation d'Emilie Simon aux
Eurockéennes de Belfort en 2005, une tournée en 2006 en première partie du groupe mondialement connu de
Placebo, de nombreux concerts en France, notamment l'
Olympia dont un Cd live intitulé « A l'Olympia » y est enregistré, et à l'étranger (
Allemagne et
Etats-Unis), attestent de sa célébrité et de son talent. Charmeuse des mots et des sons, on découvre, ou on retrouve, dans ce dernier album, une créatrice de musique électro-pop contemporaine, qui précise elle-même qu'« Il ne faut pas se laisser enfermer dans un monde qui tue la créativité... ».