Dans la lignée de séries télévisées comme
NCIS ou les Experts, Bones met en scène des enquêtes criminelles scientifiques. Grâce à ces enquêtes, le Dr Temperance Brennan et son équipe doivent être capables de déterminer les circonstances ayant entrainées la mort d'individus. C'est la raison pour laquelle elle est sollicitée par les autorités policières dans le but de résoudre des énigmes criminelles. En ce qui concerne l'agent du FBI, Seeley Booth, il a pour objectif d'accompagner le Dr Temperance Brennan dans ses recherches. La relation que le duo entretient est parfois complexe. Les personnages sont parfois en conflit, bien qu'une grande complicité les unisse. Le Dr Temperance Brennan est assistée d'une équipe de choix. Il y a Angela Montenegro, spécialisée dans la reconstruction faciale. C'est aussi une artiste de talent et l'amie du Dr Temperance Brennan. Zack Addy travaille également à l'institut Jefferson en tant qu'assistant. Il est étudiant en anthropologie. Quant au Dr Jack Hodgins, il travaille en tant qu'endomologue (étude des insectes). On découvrira au fil des épisodes de Bones qu'il est issu d'une famille très aisée et qu'il fait partie du principal groupe donateur de l'institut Jefferson.