L'alcoolémie est identique chez la mère que chez le foetus. En outre, l'élimination de l'alcool chez ce dernier est plus lente et très toxique pour l'organisme fragile du bébé. Au début de la grossesse, le bébé est sujet à des troubles de
croissance graves, à des malformations diverses. On note en effet, un déséquilibre sur le rythme de croissance du crâne et de la face. Le physique d'un bébé exposé à la consommation d'alcool de la mère porteuse avant sa naissance est très caractéristique au niveau du visage, on observe alors un nez aplati et court, de petits yeux et une petite tête. Les malformations touchent également les organes tels que le coeur avec les cardiopathies congénitales, les malformations osseuses, les anomalies cutanées.... Le bébé risque aussi, plus tard, à la naissance, d'être victime de retard psychomoteur. A partir du quatrième mois de grossesse, les troubles s'accentuent et peuvent même aboutir à une naissance prématurée. En outre, le système nerveux du foetus est très sensible à l'alcool à cette période, ce qui aggravera les troubles psychiques et moteurs du bébé lorsqu'il naîtra.